O Dr. Kenzou Tenma, um neurocirurgião de elite recém-contratado para a filha do diretor do hospital, está a caminho de subir na hierarquia do hospital. Isso é até uma noite, um evento aparentemente pequeno muda a vida do Dr. Tenma para sempre. Enquanto se prepara para realizar uma cirurgia em alguém, ele recebe uma ligação do diretor do hospital, dizendo-lhe para trocar de paciente e, em vez disso, realizar uma cirurgia no cérebro que salva vidas em um artista famoso. Seus colegas médicos, noiva e diretor do hospital aplaudem sua realização; mas, devido à mudança, um trabalhador imigrante pobre está morto, fazendo com que o Dr. Tenma tenha uma crise de consciência. Então, quando surge uma situação semelhante, o Dr. Tenma se mantém firme e decide realizar uma cirurgia no jovem Johan Liebert, em vez do prefeito da cidade. Infelizmente, essa escolha leva a sérias ramificações para o Dr. Tenma - perdendo sua posição social, sendo uma delas. No entanto, com a morte misteriosa do diretor e de outros dois médicos, a posição do Dr. Tenma é restaurada. Sem provas para condená-lo, ele é libertado e continua a ocupar o cargo de diretor do hospital. Nove anos depois, quando o Dr. Tenma salva a vida de um criminoso, seu passado volta para assombrá-lo - mais uma vez, ele fica cara a cara com o monstro em que operava. Agora, ele deve embarcar em uma busca para compensar o caos causado por quem salvou.